Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms