Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XPCQ01831 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XPCQ01831 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms