Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HOXC5Q00444 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms