Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HBBP68871 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBBP68871 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms