Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms