Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA8P48165 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA8P48165 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA8P48165 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms