Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms