Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA2P42262 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms