Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX11P35716 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX11P35716 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms