Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GPC1P35052 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GPC1P35052 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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