Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBP2P32456 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GBP2P32456 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GBP2P32456 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GBP2P32456 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms