Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms