Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK11BP21127 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms