Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATF3P18847 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms