Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms