Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA4P13612 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms