Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms