Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF1P10914 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms