Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LYNX1P0DP58 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms