Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRR35P0CG20 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms