Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms