Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL3O95573 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms