Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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