Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MATN4O95460 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MATN4O95460 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms