Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTNSO60931 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTNSO60931 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CTNSO60931 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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