Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP9BO43861 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP9BO43861 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms