Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALUO43852 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALUO43852 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALUO43852 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms