Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNPHO15079 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNPHO15079 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNPHO15079 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNPHO15079 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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