Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DGG1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms