Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA6BA6NDN3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms