Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54L2Q9Y4B4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54L2Q9Y4B4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms