Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP11Q9Y3A2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP11Q9Y3A2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms