Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK1Q9UPV9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms