Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SETD1BQ9UPS6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SETD1BQ9UPS6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SETD1BQ9UPS6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SETD1BQ9UPS6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SETD1BQ9UPS6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.3 ms