Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms