Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms