Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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CNTN3Q9P232 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CNTN3Q9P232 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTN3Q9P232 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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