Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms