Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYLDQ9NQC7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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