Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PARD6AQ9NPB6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms