Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA8Q9NP80 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms