Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLSPNQ9HAW4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLSPNQ9HAW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms