Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms