Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms