Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms