Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms