Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5DQ9BY66 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms