Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GABARAPL3Q9BY60 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms