Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms