Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms